Sorry, I understood that he wanted to run the dump with the cartridge, not actually edit the cartridge.Você não pode editar o arquivo do jogo real do cartucho porque é somente leitura. No entanto, você pode despejar o jogo do seu cartucho em um arquivo de formato CIA que você pode instalar em seu 3ds e, em seguida, aplicar o patch conforme indicado neste post.
However, if when creating a cia file from the original cartridge, it does not have the correct crc (check page 1 of this post), it will not work